Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RpainQ9CWY9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RpainQ9CWY9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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