Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Khdc3Q9CWU5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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