Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms