Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Pfdn1Q9CWM4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Pfdn1Q9CWM4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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