Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fcf1Q9CTH6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Fcf1Q9CTH6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fcf1Q9CTH6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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