Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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