Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snw1Q9CSN1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms