Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Nicn1Q9CQM0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Nicn1Q9CQM0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Nicn1Q9CQM0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Nicn1Q9CQM0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Nicn1Q9CQM0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Nicn1Q9CQM0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nicn1Q9CQM0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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Nicn1Q9CQM0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms