Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufb9Q9CQJ8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms