Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms