Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE3

Mrps17, 28S ribosomal protein S17, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps17Q9CQE3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps17Q9CQE3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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