Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms