Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb1Q9CPU1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms