Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sike1Q9CPR7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms