Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms