Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ms4a6dQ99N07 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a6dQ99N07 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a6dQ99N07 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a6dQ99N07 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a6dQ99N07 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a6dQ99N07 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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