Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms