Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms