Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms