Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms