Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms