Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms