Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms