Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab28Q99KL7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms