Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ddb2Q99J79 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ddb2Q99J79 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ddb2Q99J79 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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