Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf144aQ925F3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf144aQ925F3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf144aQ925F3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf144aQ925F3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf144aQ925F3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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