Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim59Q922Y2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms