Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubxn1Q922Y1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms