Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms