Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms