Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms