Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms