Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx9Q91VH2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx9Q91VH2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms