Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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