Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Stx18Q8VDS8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Stx18Q8VDS8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Stx18Q8VDS8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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