Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TgdsQ8VDR7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TgdsQ8VDR7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms