Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GcaQ8VC88 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
GcaQ8VC88 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms