Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ApobrQ8VBT6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms