Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpsap2Q8R574 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms