Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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