Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg10Q8R1P4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms