Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J6

Trnt1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

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Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trnt1Q8K1J6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trnt1Q8K1J6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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