Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cnppd1Q8K158 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cnppd1Q8K158 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cnppd1Q8K158 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cnppd1Q8K158 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cnppd1Q8K158 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cnppd1Q8K158 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Cnppd1Q8K158 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnppd1Q8K158 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnppd1Q8K158 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms