Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms