Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CopaQ8CIE6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopaQ8CIE6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms