Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cog3Q8CI04 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms