Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tshz3Q8CGV9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms