Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ercc8Q8CFD5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ercc8Q8CFD5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ercc8Q8CFD5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ercc8Q8CFD5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ercc8Q8CFD5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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