Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Gm9955Q8CEJ8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Gm9955Q8CEJ8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Gm9955Q8CEJ8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Gm9955Q8CEJ8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Gm9955Q8CEJ8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm9955Q8CEJ8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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