Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms